肖正涛
特聘研究员 博士生导师
基础医学院/转化医学研究院 生物化学与分子生物学系/分子转化医学研究所
个人简介
2017 年获清华大学理学博士学位，随后赴美国杜克大学药理学与癌症生物学系开展博士后研究；2021 年加入西安交通大学基础医学院，入选西安交通大学青年拔尖人才（B）。
课题组聚焦肿瘤微环境与复杂疾病的系统调控机制，融合单细胞与空间多组学、生物信息学、系统生物学、人工智能及实验验证，解析疾病发生发展中的细胞状态变化、分子调控网络与关键驱动因素；同时发展智能化生物信息分析方法和AI 智能体技术，推动疾病机制解析、治疗靶点发现与精准医学转化。
研究方向
1.单细胞与空间多组学：面向复杂疾病的细胞图谱，精准识别关键致病细胞群及核心调控因子。
2.肿瘤代谢与免疫微环境：在单细胞尺度解析肿瘤代谢异质性，揭示代谢重编程与免疫微环境调控的系统关联。
3.系统生物学与计算建模：重构分子调控网络，刻画疾病演化的细胞状态连续谱与关键驱动机制。
4.AI 智能体与精准医学：发展智能化生物信息分析方法与AI智能体技术，开展靶点发现和精准医学转化研究。
代表性研究成果
1.单细胞与空间组学分析新技术：开发基因网络差异分析算法scDNS和稀有细胞识别算法RareQ，实现关键细胞群与核心调控因子的协同识别。相关成果发表于 Nature Communications（2026，2 篇）。
2.肿瘤代谢重编程与免疫微环境解析：建立单细胞尺度肿瘤代谢分析体系，开发代谢活性推断方法iMetAct，系统解析肿瘤代谢异质性及其与免疫微环境之间的关联。相关成果发表于 Nature Communications（2019）和 Cell Reports（2025）。
3.肿瘤发生演化与精准干预：构建肺腺癌EMT细胞状态连续谱，并以计算驱动的药物发现策略识别Digitoxin的潜在治疗价值。相关成果发表于Cancer Gene Therapy（2026）和British Journal of Pharmacology（2025）。
教育与工作经历
• 2021.01—至今特聘研究员、博士生导师，西安交通大学基础医学院
（2026 年起同时受聘为西安交通大学第二附属医院特聘教授）
• 2017.09—2020.12博士后，美国杜克大学药理学与癌症生物学系
• 2013.09—2017.07博士，清华大学生命科学学院
荣誉与科研项目
• 陕西省高层次青年人才、秦创原创新创业人才
• Robert J. Fitzgerald Scholar Award（美国杜克大学，2020）
• 国家自然科学基金青年及面上项目、省部级科研项目
代表性论文
1.Chelerythrine and chelidonine synergistically target the adenosine pathway to improve anti-PD-L1 immunotherapy efficacy in lung cancer. Phytomedicine, 160, 158701, 2026.
2.eIF3e-mediated translational checkpoint maintains immune tolerance and prevents lymphoid malignancy. Journal of Experimental Medicine, 223(8), e20251968, 2026.
3.Characterizing gene perturbations in single cells via network divergence analysis. Nature Communications, 17, 5150, 2026.
4.Cell neighborhood topology directs rare cell population identification. Nature Communications, 17, 4618, 2026.
5.Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression. Cancer Gene Therapy, 33, 186–197, 2026.
6.S100A11/ANXA2 axis mediates electrotransduction to promote electrically-induced contraction in engineered myocardial tissues. Biomaterials, 327, 123712, 2026.
7.iMetAct: An integrated systematic inference of metabolic activity for dissecting tumor metabolic preference and tumor-immune microenvironment. Cell Reports, 44(3), 115375, 2025.
8.Systematic drug screening and target analysis identify digitoxin as a potential therapy for uveal melanoma. British Journal of Pharmacology, 182, 1275–1291, 2025.
9.De novo Identification of Actively Translated Open Reading Frames with Ribosome Profiling Data. Journal of Visualized Experiments, Article 63366, 2022.
10. Epigenomic links from metabolism—methionine and chromatin architecture. Current Opinion in Chemical Biology, 63, 11–18, 2021.
11. Metabolic landscape of the tumor microenvironment at single cell resolution. Nature Communications, 10, 3763（EACR Top 10 Cancer Research Publications）, 2019.
加入我们
欢迎对肿瘤代谢、免疫微环境及复杂疾病研究感兴趣的同学来信交流。课题组综合运用单细胞与空间组学、生物信息学、人工智能和生物医学实验等方法开展“干-湿”结合研究，欢迎具有计算分析或实验操作基础的同学加入。
电子邮箱：zhengtao.xiao@xjtu.edu.cn
通讯地址：西安交通大学创新港21 号楼
实验室主页：https://xiaolab-xjtu.github.io
