研究领域（方向）
1. 开发结合人工智能与纳米孔测序的新型RNA修饰检测技术，解决RNA修饰低丰度和难定位的技术瓶颈。
2. 探索RNA修饰在泌尿系统肿瘤中的调控机制，解析其异常调控在肿瘤发生与发展中的促癌作用及机制。
3. 基于RNA修饰的调控机制，研究靶向RNA修饰的治疗策略，探索其在精准医学和肿瘤治疗中的应用潜力。
个人及工作简历
2016年7月毕业于于中国科学院上海生命科学研究院获生物信息学博士学位。 曾在约翰霍普金斯大学（2016年8 月 - 2018年7月，生物信息学博士后）、美国休斯敦卫理公会医院/康奈尔大学医学院（2018年7月 - 2020年10 月，生物信息学博士后）、哈佛大学医学院/波士顿儿童医院（2020年11月 - 2022年10月，生物信息学博士后；2022年10月 - 2025年3月, 讲师, 研究科学家）等机构从事研究工作，积累了丰富的跨学科研究经验。2025年3月加入西安交通大学第一附属医院泌尿外科。
科研项目
RNA修饰与前列腺癌 国家级青年人才项目 2026.01-2028.12 主持
肾癌新型RNA修饰与可变剪接 面上项目 2027.01-2030.12 主持
学术及科研成果、专利、论文
主要聚焦利用人工智结合生物医学大数据进行肿瘤和心血管疾病的分子机制研究，围绕“RNA修饰与肿瘤”与“表观调控机制与前列腺癌恶性进展”等前沿科学问题，开展了系列研究。开发了基于人工智能分析RNA修饰的新算法，发现mRNA新修饰2‘-O-Me (Nm) 促进RNA的稳定性，参与前列腺癌发生发展。揭示了前列腺癌癌基因EZH2具有调控RNA修饰的新功能，阐明了其通过调控核糖体RNA修饰介导促癌蛋白翻译及转录激活CDCA8蛋白，引起肿瘤恶性进展的新机制, 发现RNA修饰m6A参与细胞命运基因独特的RNA低稳定性的调控。以第一（含共同）或者通讯作者在 iMeta (通信作者, 2026) 、Trends In Biochemical Biology (通信作者, 2026) 、Nature Commutations（共同第一，2026）、 Nature Cell Biology（共同第一，2021）、Molecular Cell （第一作者，2024）、Nucleic Acids Research（第一作者，2023）和 Oncogene（共同第一，2022） 等杂志发表研究论文12篇, 以及其它署名作者13篇, 系统阐述了Nm介导的mRNA修饰和rRNA的修饰参与前列腺癌发生发展的机制，累计引用逾1600次。
代表性论文:
Tianyuan Zhang†^, Jia Li†, Chao Tang†, You Wu†, Hao Wu†, Xi-Tong Zhu†, Ziyang Luo†, Hang Qin†, Lishan Ding†, Yu Zeng, Shiou Yih Lee, Xiaotao Shen, Shiwen Gao, Zhaoyang Tian, Qian Tang, Mian Li, Muhammad Tahir Ul Qamar, Yang Dong, Komivi Dossa, Yaxuan Zhang, Hu Chen*, Sanqi An*, Xiang Yu*, Lu Chen*, Dingjie Wang*, Shengli Li*, Ling-Ling Chen*, Yanqiang Li*. Nanopore Direct RNA Sequencing and the Epitranscriptome: Advances in Mapping Native RNA Landscapes. iMeta.1: e175.https://doi.org/10.1002/imt2.175 (2026, IF=44.4)
Hang Qin, Yajie Qi, Yanqiang Li*. Adenosylhomocysteinase–adenosine complex links m6A and cancer lipid metabolism. Trends in Biochemical Sciences. 10.1016/j.tibs.2026.02.016. (2026, IF=14.4)
Yang Yi†, Yanqiang Li†, Rui Wang, Xufen Yu, Qi Liu, Chaehyun Yum, Yang Zhang, Yuanyuan Qiao, Aileen Szczepanski, Siqi Wu, Qiaqia Li, Ladan Fazli, Jiangchuan Shen, Xin Wang, Xiaoling Li, Ping Mu, Edward M. Schaeffer, Heather A. Hundley, Hengyao Niu, Arul M. Chinnaiyan, Lu Wang, Jinjun Shi, Jian Jin, Xuesen Dong, Wei Zhao, Kaifu Chen*, Qi Cao*. A dual role of EZH2 in regulating A-to-I RNA editing and mRNA stability through ADAR1. Nature Communications 2026 17, 4421 (IF=18.1)
Yanqiang Li†, Yang Yi†, Xinlei Gao, Xin Wang, Dongyu Zhao, Lili Zhang, Qi Cao*, Kaifu Chen*. 2’-O-Methylation at internal site on mRNA promotes RNA stability, Molecular Cell 84.12 2024 2320-2336. IF=16.6).
Yanqiang Li†, Yang Yi†, Jie Lv, Xinlei Gao, Yang Yu, Sahana Suresh Babu, Ivone Bruno, Dongyu Zhao, Bo Xia, Hong Chen, Qi Cao*, Lili Zhang*, Kaifu Chen*. Low RNA stability signifies increased post-transcriptional regulation of cell identity gene expression. Nucleic Acids Research, 2023 July 7;51(12):6020-6038 (IF=16.9)
Kaiyuan Wu†, Yanqiang Li†*, Yang Yi, Lili Zhang, Qi Cao, Kaifu Chen*. The detection, function, and therapeutic potential of RNA 2'-O-methylation. The Innovation Life, (2025) 3(1), 100112
Yanqiang Li*, Jiayi Chen, Yunxia Wang, Jiahan Li, Yang Yi, Lili Zhang, Qi Cao, Kaifu Chen*. Protocol for mapping 2’-O-Methylation using nanopore direct RNA-seq data with NanoNm. STAR Protocols. 2025. (IF=1.4)
Yang Yi†, Yanqiang Li†, Qingshu Meng†, Qiaqia Li, Fuxi Li, Bing Lu, Jiangchuan Shen, Ladan Fazli, Dongyu Zhao, Chao Li, Weihua Jiang, Rui Wang, Qipeng Liu, Aileen Szczepanski, Qianru Li, Wei Qin, Adam B. Weiner , Tamara L. Lotan, Zhe Ji, Sundeep Kalantry, Lu Wang, Edward M. Schaeffer , Hengyao Niu, Wei Zhao，Kaifu Chen*, Qi Cao*. A PRC2-independent function for EZH2 in regulating rRNA 2′-O methylation and IRES-dependent translation. Nature Cell Biology, 2021, 23,341–354 (IF=28.82)
Yifan Lv†, Fan Xia†, Jing Yu†, Yunlu Sheng, Yi Jin, Yanqiang Li*, Guoxian Ding*. Distinct response of adipocyte progenitors to glucocorticoids determines visceral obesity via the TEAD1-miR-27b-PRDM16 axis. Obesity. (2023, IF=6.9).
Yang Yi†, Yanqiang Li†, Chao Li†, Longxiang Wu, Dongyu Zhao, Fuxi Li, Ladan Fazli, Rui Wang, Xuesen Dong, Wei Zhao, Kaifu Chen*, Qi Cao*. Methylation-dependent and -independent roles of EZH2 coordinately contribute to CDCA8 activation in prostate cancer. Oncogene, 2022,1-12 (IF=9.87)
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